SERVIZIO  MICROARRAY

La tecnologia dei microarray fornisce ai ricercatori l'opportunità di analizzare velocemente ed in modo simultaneo decine di migliaia di geni, o addirittura l'intero genoma di un organismo (ad esempio batteri, lievito, virus, protozoi, topo o uomo), in un singolo esperimento. Questo approccio permette di recuperare informazioni sulle interazioni geniche e sulla funzione dei geni stessi.

I potenziali utenti sono ricercatori interessati agli:
- studi di promotori;
oppure alle differenze di espressione tra:
- un tessuto patologico ed un tessuto normale (tumori, distrofie ecc.);
- un topo normale ed un topo knock-out (modelli di patologie);
- cellule, tessuti od organismi trattati con un qualche farmaco o sostanza
- cellule, tessuti od organismi non trattati (farmacogenomica, bioindicatori ambientali).

Negli ultimi tre anni sono stati messi a punto la strumentazione (Biorobotics Microgrid II Spotter, Perkin Elmer ScanArray LITE Scanner e Agilent Bioanalyzer 2100) e i protocolli per la produzione e l'utilizzo della tecnologia. Questo ha permesso al gruppo di fornire: 1) un servizio custom di spottaggio, 2) una serie di piattaforme di microarray per studiare l'espressione genica in topo e uomo, 3) il controllo della qualità dell'RNA e 4) un supporto per l'analisi statistica dei dati di microarray.

Usando le proprie piattaforme di topo, il gruppo ha studiato l'espressione genica durante la denervazione del muscolo e in un topo knock-out per un gene coinvolto nello sviluppo di cardiomiopatie, mentre con le piattaforme di uomo si stanno studiando patologie muscolari (LGMD2B, LGMD2A, CMD, FSHMD), cardiomiopatie, leucemie e interazione di fattori di trascrizione. Inoltre, per facilitare l'analisi dei dati è stato sviluppato un software gratuito (MIDAW).

Ci sono molte ditte come Affymetrics, Agilent o Applied Biosystems che vendono microarray, ma il loro limite è rappresentato dai costi elevati. Il Servizio Microarray del CRIBI garantisce elevata omogeneità degli spot sullo stesso vetrino, la presenza di controlli di qualità interni e prezzi estremamente competitivi: ciò gli consente di essere punto di riferimento di molti ricercatori italiani per la tecnologia dei microarray.